Links til forskellige (Q)SAR værktøjer

En række (Q)SAR værktøjer og databaser kan findes frit tilgængeligt på Internettet. I den følgende tekst findes en kort beskrivelse samt links til nogle af de systemer som anvendes mest i forbindelse med arbejdet med kemikalieregulering.

AMBIT XT
AMBIT XT er udviklet af den kemiske industri. Databasen deholder bl.a. forskellige moduler til PBT (persistente, bioakkumulerbare, giftige) vurdering, identificering af strukturanaloger og bygning af kemiske kategorier. Systemet indeholder både (Q)SAR forudsigelser og testdata.

AMBIT XT's hjemmeside

CAESAR
CAESAR udgøres af en gruppe (Q)SAR modeller, som er udviklet specifikt med henblik på at kunne anvendes under REACH. Projektet, som blev finansieret af EU, har udviklet modeller for biokoncentrationsfaktor (BCF), hudallergi, kræft, mutagenicitet (skader på arveanlæggene) og reprodukltionstoksicitet (skader på forplantningsevnen og normal udvikling herunder fosterskader). 

CAESAR projektets hjemmeside

Den danske (Q)SAR database
Den danske (Q)SAR database er udviklet af en forskergruppe på DTU Fødevareinstituttet med støtte fra bl.a. Miljøstyrelsen. Databasen indeholder estimater for mere end 170.000 organiske stoffer fra mere end 70 forskellige (Q)SAR modeller. 

Databasen indeholder både bl.a. forudsigelser for en lang række humantoksikologiske effekter samt for giftighed over for organismer, som anvendes til vurdering af effekter i miljøet.

Den danske (Q)SAR database blev offentliggjort i 2004 og er frit tilgængeligt på Internettet. I databasen kan man søge efter et konkret stofs modellerede effekter/egenskaber.

Den danske (Q)SAR database (På DTU Fødevareinstituttets hjemmeside)

Den vejledende liste til selvklassificering
Forudsigelser fra den danske (Q)SAR database er anvendt til at udlede vejledende selvklassificeringer for over 30.000 stoffer. Listen over selvklassificeringer samt baggrundsdokumentation kan findes på Miljøstyrelsens hjemmeside:

Den vejledende liste til selvklassificering af farlige stoffer.

EPISUITE
EPISUITE er en samlebetegnelse for en gruppe af forskellige (Q)SAR modeller udviklet af den amerikanske miljøstyrelse (US EPA). Pakken indeholder bl.a. modeller, som kan forudsige fysisk-kemiske egenskaber som log Kow (KOWWIN), vandopløselighed (WsKOW), Henrys konstant (HenryWin) etc. Der indgår desuden modeller, som kan forudsige organiske stoffers skæbne i miljøet herunder bioakkumuleringspotentiale (BCFBAF), bionedbrydelighed (BioWin) og hydrolyserate (HydroWin). Endeligt indgår modeller, der kan forudsige giftigheden af organiske stoffer over for vandlevende organismer (Ecosar). 

EPISUITE er et gratis program og kan downloades fra den amerikanske miljøstyrelses hjemmeside. Her findes der også flere informationer om programmet og modellerne:

EPISUITE (på den amerikanske miljøstyrelses hjemmeside)

LAZAR
(Q)SAR modeller for bl.a. giftighed over for fisk, human lever toxicitet, mutagenicitet og kræft. Softwareprogrammet angiver endvidere de 10 nærmeste naboer (de 10 kemikalier i træningssættet, som har størst lighed med det undersøgte kemikalie).

LAZAR's hjemmeside 

NCI Database
NCI databasen, som er udviklet af det amerikanske National Center for Cancer Research, indeholder (Q)SAR forudsigelser for en lang række biologiske aktiviteter. De kan bl.a anvendes til at udrede forskellige typer af virkningsmekanismer for kemiske stoffer (herunder virkningsmekanismer i forbindelse med udvikling af kræft). 

NCI databasen

OECD (Q)SAR Application Toolbox
OECD har sponsoreret udviklingen af ekspertsystemet ’OECD (Q)SAR Application Toolbox’. Programmet kan anvendes til at gruppere kemikalier i kategorier samt give en bedre mekanistisk forståelse for en given effekt. I OECD (Q)SAR Toolboxen er der desuden mulighed for, at man kan udvikle sine egne (Q)SAR modeller. I tillæg hertil indeholder systemet en stor mængde testdata, således at det både kan anvendes til at identificere testdata og til at udfylde datahuller vedread-across og (Q)SAR modellering ved manglende testdata for et givent kemikalie. 

OECD (Q)SAR Toolboxen indeholder endvidere forudsigelserne fra den danske (Q)SAR database.

Programmet kan downloades gratis fra OECD’s hjemmeside:

OECD (Q)SAR Application Toolbox

PBT profiler
PBT profiler er udviklet af den amerikanske miljøstyrelse (US EPA), med det formål at kunne identificere mulige PBT stoffer (stoffer som er persistente, bioakkumulerbare og toksiske) ved manglende testdata. Programmet kombinerer forudsigelser for et kemikalies nedbrydning, Bioakkumulering (BCF) og giftighed med estimater for fordeling i miljøet. PBT profiler anvender (Q)SAR forudsigelser fra EPISUITE, som sammenholdes med amerikanske afskæringsgrænser i forhold til PBT kriterier. 

Programmet er gratis tilgængeligt online:

http://www.pbtprofiler.net/

SPARC
SPARC er et gratis onlineværktøj, der kan give estimater for fysisk/kemiske egenskaber bl.a. visse egenskaber, som ikke er dækket af EPIWIN modellerne (f.eks. log D). 

SPARC hjemmesiden

Toxtree
Toxtree er et beslutningstræ hvor såkaldte “structural alerts” (fragmenter på molekylet, som vides at være forbundet med en særlig effekt f.eks. mutagenicitet) anvendes til at inddele kemikalier i forskellige klasser. Toxtree kan downloades fra ECB’s (det Europæiske Kemikaliebureaus) hjemmeside: 

Toxtree (på det Europæiske Kemikaliebureaus hjemmeside)

Kommercielle modeller
Der findes en række kommercielle modeller, som kræver brugerbetaling forud for anvendelse. Flere af disse systemer kan dog i begrænset omfang anvendes gratis. Eksempler på kommercielle (Q)SAR systemer er: ACD/Tox Suite, MultiCASE, MDL QSAR, LEADSCOPE, TOPKAT, DEREK for Windows, CATABOL, METEOR, META, Simulation Plus.