Væsentlige dele af reguleringen af miljøområdet bygger på EU-retsakter, f.eks. direktiver.
Et af de direktiver, der betyder meget for den danske regulering af virksomheder og landbrug, er IPPC- direktivet (Europaparlamentets og Rådets direktiv 2008/1/EF af 15. januar 2008 om integreret forebyggelse og bekæmpelse af forurening). Formålet med direktivet er bl.a. at sikre en mere sammenhængende godkendelsesproces for forurenende virksomheder.
IPPC-direktivet erstattes af det nye IE-direktiv (Industrial Emissions Directive). Det er trådt i kraft d. 6. januar 2011 og skal inden d. 6. januar 2013 implementeres i dansk ret gennem ændring af love og bekendtgørelser.
IED- direktivet samler syv eksisterende direktiver om industriemissioner i et direktiv:
Henstillingen, RMCEI, (2001/331/EF) opstiller mindstekrav, som medlemsstaterne anbefales at følge. Henstillingen siger bl.a. noget om tilrettelæggelse og udførelse af miljøtilsyn, tilsynsplaner, fysiske tilsyn og afrapportering. Kommissionen følger jævnligt op på i hvilket omfang medlemsstaterne efterlever henstillingen.RMCEI-2001-331-EC.pdf